#NEXUS 
[MacClade 4.06 registered to Scott Edwards, University of Washington]


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charset indel = 55-60 64-65 882-898 973-979 1111-1116 1459-1463 1741 2510 2549-2573; [indels]
outgroup Lsuavissima5065;

constraint manacus 100 = Maur2313a Maur2313b Maur2315a Maur2315b Mcan1920a Mcan1920b Mcan1924a Mcan1924b Mcan16157a Mcan16157b Mcan16282a Mcan16282b Mman2583a
                     Mman2583b Mman2678a Mman2678b Mman4910a Mman4910b Mman9197a Mman9197b Mman9770a Mman9770b Mman9771a Mman9771b Mman11782a Mman11782b
                     Mman2394a Mman2394b Mman2407a Mman2407b Mman12013a Mman12013b Mman12029a Mman12029b Mvit1251a Mvit1251b Mvit1858a Mvit1858b Mvit1862a Mvit1862b;
                     
           outtaxa1 200 = Agaleata13815 Cpareola6864;
           outtaxa2 300 = Agaleata13815 Cpareola6864 Cleucorrhoa2085;
           outtaxa3 400 = Pmentalis1084 Dpipra5013;
           outtaxa4 500 = Pmentalis1084 Dpipra5013 Agaleata13815 Cpareola6864 Cleucorrhoa2085;
           outtaxa5 600 = Pfasciicauda4316 Pmentalis1084 Dpipra5013 Agaleata13815 Cpareola6864 Cleucorrhoa2085;
           outtaxa6 700 = Lsuavissima5065 Pfasciicauda4316 Pmentalis1084 Dpipra5013 Agaleata13815 Cpareola6864 Cleucorrhoa2085;
           
exclude all;
include nr;
exclude indel;
                     

lset nuc=4by4 nst=6 ra=invgamma;

[prset topologypr = constraints(manacus,outtaxa1,outtaxa2,outtaxa3,outtaxa4,outtaxa5,outtaxa6);]

unlink tratio=(all) ;

mcmc seed=4578 ngen=5000000 printfreq=100 samplefreq=1000 savebrlens=yes nchains=4 burnin=500000 diagnfreq=10000;

END;